我國可以作為能源利用的生物質資源主要以秸稈為主，林業加工剩余物的比例相對較小。秸稈的收集和運輸是將田間的廢棄桔稈采用較為經濟的收集方式和設備進行收集并通過運輸工具運送至秸稈加工及利用場所，以達到秸稈轉化利用的目的。由于農作物秸稈普遍存在著松散、質輕以及分散、季節性強等特點，秸稈的收集和運輸成本往往在秸稈能源化利用經濟鏈條中占據較大的份額。

　　將糧食收獲后的田間廢棄桔稈進行收集，然后將其運送至秸稈加工或利用場所，條件允許也可以進行適當的晾曬、粉碎、打捆等處理以便于運輸，甚至可以進行田間壓塊處理，然后直接運送至秸稈利用場所儲存或直接利用。秸稈預處理可根據桔稈種類和過程經濟性的不同選擇適宜的方式，一般玉米秸稈、小麥秸稈、稻草等軟質農作物秸稈在田間直接將其搞成高密度的捆后再進行運輸，而棉花秸稈、大豆秸稈等硬質秸稈則一般可將其粉碎后再進行運輸。將秸稈進行田間直接壓塊，可以人大提高運輸和儲存性能，直接運送至秸稈利用場所可以減少中間環節和成本，但是壓塊過程將顯著提高秸稈的收購成本。田間秸稈收集過程可以由農戶分散進行，也可以由專門收購商采用專業設備進行規模化的收集處理。

　　秸稈的運輸應該綜合考慮桔稈形式(散料、打捆、壓塊等)、運輸方式(卡車畜力車)、運輸距離以及單價運輸成本等方面，確定合理的運輸方式和收集半徑，的收集和運輸成本。

　　儲存及加工主要是將田間運送來的秸殲進行處理，改變形狀成質量，目的是提高秸稈的儲存性能，延長存放時間，并將秸稈處理成利用過程所需要的形式。根據利用方式的不同，可進行切割、粉碎、打捆、壓塊成型、顆粒、氨化、堆肥等處理和加工.以便十后續的秸稈儲存和利用。對于秸稈的處理目前開發的相關設備非常多，如打捆機、集捆機、切割機、粉碎機、壓塊機以及成型顆粒機等。生物質秸稈利用主要是將秸稈或是經過加工的秸稈進行適當的存儲并加以利用。可作為育儲、黃儲飼料供牲畜食用，也可作為鍋爐的燃料供居民采暖或是發電等。

　　秸稈的收集和運輸應考慮當地的具體資源情況和種植利用實際，選擇適當的方式，綜合考慮秸稈的收集半徑、收集周期、秸稈可獲得量等相關因素，發揮出秸稈利用的經濟效益。